而在2009年，重慶秀山縣也曾爆出303個“癌癥病人”以在外地務工得絕癥為名，偽造多家醫院病歷資料，向該縣農村合作醫療基金辦公室“報銷”449萬余元的事件。
　　
　　據《重慶晚報》報道，受理該案的重慶市檢察院第四分院認為，這起情節看似簡單的詐騙案暴露出新農合基金的一些漏洞，故向衛生部反映有關情況，建議提高警惕，仔細審核報銷發票，注意鑒別病歷真偽。
　　
　　趙亞春說，她手里還有一張開自四川某醫院的可疑票據，但她已經打了四五次電話，對方醫院一直不配合。
　　
　　“全區七八萬參合農民，每年補償額幾百萬元，合管辦一共5個人，不可能每張票據都去查，更不可能出省去查。沒有人手，也沒有這筆經費。”趙亞春建議，全國各大醫院都能建立起北京301醫院那樣的查詢系統，以方便各新農合管理機構核查。
　　
　　沈文生說，吉林省各縣市的新農合管理機構通常只有幾個人或者十幾個人，要面對的是全縣十幾萬甚至幾十萬參合農民，還有十幾個鄉鎮衛生院、上百個診所，審核工作全憑人工操作、肉眼識別，無論是監管力量和監管手段都難以滿足新農合迅速發展的需要。
　　
　　李久春對這種情況有一個比喻：“一只貓面對100只老鼠，抓了這只，跑了一群。”
　　
　　有人認為，詐騙新農合基金的事件接連發生，意味著新農合基金這塊蛋糕，已經被社會上一些不法分子盯上，他們通過制假、購假從中漁利，其行為已經涉及違法甚至犯罪。
　　
　　前述騙合農民董某稱，北京301醫院門前，出售醫療票據就像賣冰糕一樣平常，花三五百元就能買到上萬元的發票，而且是成套的，包括完整的病歷。“他們說是通過關系從醫院內部開出來的，是真的。”
　　
　　趙亞春認為，對于制造販賣假病歷和假發票這樣的違法犯罪行為，需要各級公安機關聯手打擊，至于是否有醫療機構人員參與其中，也需要紀檢部門進行監督檢查。
　　
　　衛生部農村衛生管理司副司長聶春雷在2009年7月的新聞發布會上表示，該部準備從當年開始用三年的時間實現農民在省內就醫直報。“從我們了解的情況看，新農合83%的農民都是在縣內看病，現在縣內是在哪兒看病在哪兒報銷，當時結賬。但是到了縣外，農民看病以后，先交錢，然后拿著票據回去報，所以有些就弄了一些假的票據。為了杜絕這種現象，我們總結了一些省的經驗，推行省內定點醫療機構直報。”
　　
　　聶春雷認為，目前全國在省內定點醫療機構看病的農民占全國農民的95%以上，如果把省內解決了，對一些不法分子的騙報將起到非常好的抑制作用。對于其余需要出省的情況，“我們也在研究將來采取什么樣的特殊辦法，能夠加強這方面的控制。”
　　
　　“醫院掙了錢，農民不受益”
　　
　　醫療機構是另一個監管難點。
　　
　　去年12月，敦化市兩個鄉鎮衛生院借年底新農合基金結算之機，以給參合者體檢的名義，套取新農合門診基金4.9萬元。事發后，兩名鄉鎮衛生院院長一遭撤職，一被記大過。
　　
　　沈文生認為，一些基層醫療機構由于財政補貼不足、生存困難，把違規違紀套取新農合基金當成獲取經濟效益的手段。
　　
　　據沈文生介紹，醫療機構套取參合基金的辦法一是“假住院”，病床明明空空如也，病歷上卻煞有介事地寫著病人在此住院治療的詳細情況；二是過度治療，青霉素能治的病非用青霉素二代、三代，開“大處方”；三是不進行合理用藥檢查，拿證就開藥。