完善科研考核評價制度。不僅要重視國家的科技論文和專利產出規模指標，而且要更加關注產出效率和產出質量。應在科技評價中采用國際科技論文的被引證數和被引頻次考核評價指標。積極支持國內研究機構在醫學等領域創辦國際一流學術期刊，提高我國科研人員國際學術影響力。企業評價和區域評價中應更加關注專利統計中本國人、內資企業擁有和使用專利的情況，促使企業增加研發投入、提高核心專利及有效專利數量。
深化科技管理改革。通過研究團隊和研究基地建設，建立財政穩定支持重點領域、重點學科基礎研究活動的投入機制，以及吸引企業投入基礎研究活動的配套政策和措施，使更多學科達到國際領先的研究水平。重視社會公益領域的科學研究。鼓勵新型研發機構和研發組織發展，探索增強國家基礎研究能力和加快科技成果產業化有機結合的新模式。推進科技服務業發展，建立學術部門和產業部門創新合作的有效機制，加強產學研合作，實現科技與經濟協調發展、緊密結合。
調整高技術產業發展思路。從注重高技術產業生產規模增長向增強高技術產業創新能力轉變，將其作為今后一個時期我國高技術產業發展的重心。大力支持內資高技術行業領軍企業的發展，帶動產業鏈整體優化升級，促進高技術產品的國內應用，逐步減少對跨國企業和國際市場的依賴。加強對我國產業技術密集度變化的監測研究，調整并確立我國近中期重點發展的高技術產業領域，拓展高技術產業政策支持領域。大力發展知識密集型服務業、具有高成長性、高創新性的戰略新興產業，形成一批具有國際競爭力高技術自主品牌。以自主創新示范區建設引導高新區升級，實現高新區產業集群由生產集群向創新集群方向發展，使之成為我國產業創新的基地，創新驅動經濟社會發展的示范區。